为了保证记分的公平、公正、公开，减少人为操作干预，打消少数报关员的侥幸心理，配合报关员记分考核办法顺利实施，目前海关总署专门组织业务、技术骨干正在开发与报关员记分考核办法相配套的报关员IC卡记分管理系统。系统是对报关员进行身份认证以及实施管理（包括实时记分）的计算机动态管理系统，统一在H2000通关系统上运行。

报关员在向海关申请办理报关手续时，必须插卡验证，该系统就会自动核对已经存储的报关员个人数据资料，对其注册登记资格和报关资格进行身份认证，并就其报关行为状态进行自动监控，一旦发现有记分情事就会电子提示告知并自动记分（部分需人工记分）。除了一年到期后系统正常自动消分外，只要有任何消分操作，系统都会留下操作人员的操作记录并提示输入消分理由。海关总署及直属海关相关职能部门可通过该系统进行日常监控，随时纠正，这样就大大降低了“人情消分”“关系消分”等情况的发生。

由于退单、撤单的情况较为复杂，出现误记分的情况不可能完全避免。因此，报关员记分考核办法规定，海关在记分时应当通过电子或纸质告知单告知报关员关于记分的项目和理由，同时明确报关员享有申辩权、复议权、诉讼权等权利。报关员对记分的行政行为有异议的，应当自收到电子或纸质告知单之日起7日内向作出该记分行政行为的海关部门提出书面申辩；海关应当在接到申辩申请7 日内作出答复，对记分错误的应当及时予以更正。对答复不服的，可以依照《中华人民共和国行政复议法》、《中华人民共和国行政诉讼法》的规定提起行政复议或者行政诉讼。报关员可以通过记分查询系统随时查询自己的记分情况，一旦出现记分错误，可以选择上述多种途径维护自己的合法权益，以保证记分的公平、公正、公开。